曹汉和孙一樵经过分析，认为凌沛东并没有就此罢手，离开重庆，他们从上官婉玉那里还是发现了一点蛛丝马迹，查到了那家德国人钟表店的电话，于是就赶到了那家钟表店。地上散落的水银引起了曹汉的，最后，他们在阁楼的箱子里找到了这家钟表店老板拉姆斯的尸体，以及制造特殊阻击步枪和水银子弹的痕迹。曹汉据此认为，上官婉玉的目的还没有完全实现。这个目的，就是刺杀蒋介石。明天，就是蒋携夫人从外面回到重庆的日子。曹汉认为，凌沛东行动的日子就在明天。
但是，那里去找凌沛东呢?
当夜，凌沛东潜伏到了教堂的楼上，将阻击步枪安装好，上了水银子弹。他在静等着一个时刻到来。
天亮了。再有几个小时，蒋介石的飞机就会降落。虽然戴笠根据曹汉的情报布置好了警卫措施，但曹汉和孙一樵的心却始终悬着在。终于，老蒋的飞机安全降落了，没有发生什么问题。就在大家认为该松一口气的时候，曹汉突然想到今天是星期日，也就是礼拜日，自从蒋介石迎娶宋美龄之后，就归依了基督教。那么，他们今天会不会去教堂做礼拜呢?这一说，让孙一樵想起前一天在教堂附近遇见凌沛东的经过。这决不是偶然的巧合，凌沛东一定另有企图。
大家立即抄小路赶往教堂。果然，蒋和夫人已经在教堂门前下车了，走进了教堂去做礼拜。
曹汉和孙一樵赶到，却又被警卫的宪兵拦住，并暂时没收了他们的手枪。
此刻，老蒋和夫人已经走到了神甫面前。顶楼上一块砖头松动了，露出了凌沛东的枪口，正瞄准着老蒋……
教堂外面的曹汉着急万分又不好解释，就在这个时候，孙一樵让“水耗子”用那只弹弓，对着教堂顶楼的大铜钟弹了过去，钟声突然大响，顶楼上正准备扣动扳机的凌沛东吓了一跳，教堂里的蒋介石也下意识地回了头，一发子弹射出，他对面的神甫当场倒下。身边的戴笠立即惊呼：有刺客!
宪兵和特工立即开始搜捕，但是凌沛东已经事先设计好了逃跑路线，他用绳索把自己从教堂的顶上荡到了一棵树上，再接着逃跑，跑出了宪兵和特工的包围圈……
惊天阴谋第30集剧情介绍(大结局)凌沛东逃出了包围圈，他来到了一个深山的庙宇里——没想到的是，他刚喘口气，就有一个声音传了过来：中岛君?
他回头一看，面前走来的竟是自己久违的妻子美惠子!原来，这个女人还是找到了重庆，当凌沛东从教堂逃出之后，她竟然在无意中看见了他的身影，于是便尾随而来。两人紧紧拥抱，美惠子告诉他，母亲已经去世了。中岛健痛哭不已，想尽快带着妻子离开重庆。但是，美惠子却说，她不打算再回去了。如果回去，她有可能被征为慰安妇，而且，她也不希望丈夫回去，在那里等待他的就是走上军事法庭的绞刑架。中岛健仰望苍天，觉得已经没有一寸落脚之地，不禁凄然。
这时一个声音在他们身后响起了——久违了，凌参谋!
中岛健一回头，身后已经出现了孙一樵、曹汉、梅岚、管家和“水耗子”，所有的枪都对准了他。可就在这时，美惠子突然喊道：别杀他!他是中国人!
大家为之一惊!中岛健也十分愕然!
于是，美惠子把婆婆临死前对她讲叙的那过去的一幕，说了出来——
三十几年前，凌梅村夫妇离开日本时，凌夫人在一家医院产下了一对双胞胎的兄弟。但是哥哥一生出来就没有了呼吸，他们只抱走了另外一个。当时，她的婆婆就是这家医院的助产士，在清理产房时，忽然听见了那个被丢弃的婴儿的一声啼哭，这孩子还活着，于是，她将孩子抱回了家，从此抚养成人。这个孩子，就是中岛健……
听完美惠子的叙述，大家突然都沉默了。管家更是泣不成声，他说：少爷，你不是已经回家了吗?可你为什么又要离开呢?
中岛健已经完全崩溃了，他面前浮现的都是那些被自己杀害的亲人，他的弟弟!他的养父!王大夫!梅检察官……他对着大家跪下了，然后几乎是癫狂地大笑起来，他笑这场战争，他笑自己的命运，突然，他拔出手枪，对准自己的太阳穴，自杀了……
他只能以这样的方式了断自己。
尾声
在秦月容的说服下，第一集团军以高荫槐为首的军官通电全国，发誓滇军将抗战到底。龙云面对这种局面，也不得不低下了头。滇军将士的义举使龙云保住了晚节，从而脱离了汪精卫集团的控制。日本大本营的《蓝色计划》彻底失败，惊天阴谋也彻底破产，土肥原贤二被撤职查办，灰溜溜地离开了上海……
一个细雨纷飞的早晨，在郊外许先生的墓前，曹汉默默献上花圈，对他说：先生，我可能又要离开一些日子，您安息吧。
在他身后，慢慢走来了孙一樵和梅岚。三人相对，尽在不言之中。天边渐渐响起了一阵轻雷，仿佛暗示着这个国家的多灾多难……
